1978年昆明理工大学在全国首批开设环境工程本科专业，培养冶金化工行业急需的污染治理人才。1983年获西南地区首个环境工程硕士学位授予权，2003年获环境工程二级学科博士学位授予权，2005年获环境科学与工程一级学科博士学位授予权。2006年环境科学与工程被列为云南省一类重点学科，2007年环境工程获批国家重点（培育）学科，并获批设立博士后科研流动站。2018年获批资源与环境领域工程博士专业学位点。
学科主动服务生态文明建设国家战略目标，聚焦冶金化工行业及西部地区特殊环境问题和环保人才需求，形成了四个优势特色学科方向。工业废气净化及资源化方向，取得具有国际领先水平的矿冶废气资源化治理技术的突破，建成冶金及化工行业废气资源化国家地方联合工程研究中心；固体废物资源化利用方向，1997年获批建设我国废弃物资源化领域唯一的国家工程研究中心；依托土壤固碳与污染控制、高原水环境污染防治学科方向，在高原红土和高原湖泊特殊环境介质相关基础科学问题方面取得了具有国际影响的学术成果。
学科拥有专职教师60人，其中正高级职称31人，副高级职称21人，82%拥有博士学位，43%具有海外学习经历；国家杰出青年基金、“何梁何利奖”获得者2人，国家“高层次人才支持计划”、“百千万人才工程”入选者等国家级人才称号10人次；柔性引进院士4人、国际知名科学家2人；建成国家级教学团队1个。拥有国家级科研平台6个，省部级科研平台15个；拥有包括国内一流大型环境风洞在内的科研基础设施和设备。
学科形成了本、硕、博层次递进，内涵连贯的完整人才培养体系。生源覆盖我国各省区和11个“一带一路”沿线国家。近五年，培养国内外本科生570人、硕士生428人、博士生137人。毕业生在国内有色行业、中西部地区及南亚东南亚国家具有明显竞争优势。
学科思政教育和师德师风建设取得突出成效，获“全国黄大年式教师团队”“全国党建工作样板支部”“全国工人先锋号”“全国模范教师”等荣誉称号。近五年，承担国家级科研项目63项，包括国家重点研发计划项目1项、课题7项，国家基金重点项目2项；科研经费规模2.4亿元。在Nature等刊物发表“三类高质量论文”545篇；出版专著19部；获授权发明专利218项，其中国际专利10项，大气污染领域专利申请量居全国高校/科研院所第7位。主要成果获国家科技进步二等奖2项，省部级科技一等奖9项，二等奖7项。学科入选ESI排名世界前1%。
